A MESI é uma das mais antigas instituições educacionais. O instituto foi fundado em 1932 como um estabelecimento de ensino superior para proporcionar educação e treinamento para áreas de estatística, economia e informática. Naquela época, era conhecido como o Instituto Moscovo de Contabilidade Econômica Nacional e, em 1945, foi renomeado o Instituto Econômico e Estatístico de Moscou (MESI). Em 1996, foi concedido o estatuto universitário. Desde o momento em que foi fundada, a MESI foi criada como o único centro educacional líder do país treinando economistas-estatísticos multi-qualificados, como um centro para aperfeiçoar a metodologia das ciências estatísticas e era bem conhecido não só na Rússia, mas também no exterior. De 1932 a 1954, a MESI se formou apenas economistas-estatísticos para as autoridades estaduais de estatística. Durante a Grande Guerra Patriótica (Segunda Guerra Mundial), o instituto foi evacuado para a cidade de Engels, região de Saratov. No verão de 1942 formou economistas-estatísticos e matriculou novos alunos para o primeiro ano de estudo. Não foi até um ano depois, quando o instituto voltou a Moscou e retomou seu trabalho. No período pós-guerra, o país precisava de uma ampla implantação de equipamentos de computação. Em conexão com isso, o marco mais importante da história da MESI foi anunciado quando o departamento de "Mecanização de Contabilidade" foi estabelecido com seus graduados atribuídos qualificação de economistas engenheiros. Mais tarde, o MESI tornou-se o principal instituto, realizando liderança metódica para capacitar economistas engenheiros em 32 instituições em todo o país. No final da década de 1960, houve esforços enormes para criar sistemas de gerenciamento automatizados e, no início da década de 1970, a MESI iniciou a formação de engenheiros de sistemas para vários níveis de gestão da economia nacional. Na década de 1990, começou a utilizar amplamente computadores pessoais que influenciaram o desenvolvimento da instituição. Naquele momento, a MESI inicia a aplicação ativa da tecnologia informática em seus programas de treinamento. Hoje, a MESI é distinta de outras faculdades devido ao uso ativo da tecnologia de e-learning. O MESI implementa todos os níveis de educação, desde a preparação dos graduados da escola até a aprendizagem de adultos e oferece uma ampla gama de programas para educação profissional e MBAs. Por seu registro de trabalho durante todos os anos, a MESI confirmou seu status como uma das principais instituições do país para capacitar pessoal qualificado em economia. Atualmente, a MESI é uma universidade líder na aplicação da mais recente tecnologia em educação e é uma das dez maiores universidades de economia de elite da Rússia.